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使用花呗付款是否会有短信提示取决于用户的花呗设置以及交易的具体情况。如果用户设置了花呗交易短信提醒功能，那么在进行花呗付款时，会收到相应的短信提示。这些短信主要是为了提醒用户该笔交易已经成功付款，以及相关的交易信息。另外，如果花呗账单金额较大或者交易环境存在风险时，花呗系统也可能会发送短信通知用户。
从安全角度来看，花呗的安全性是有一定保障的，支付宝采取了多种安全措施来保护用户的账户安全，包括数据加密、安全认证等，花呗也有一套完善的安全机制，对于异常交易会及时提醒用户，并可以采取相应的措施来保护用户的账户安全。
尽管花呗的安全性较高，但用户仍需注意一些安全问题，不要将支付宝账号、密码等重要信息泄露给他人，避免在不安全的网络环境下使用花呗等，如果收到可疑的短信或电话，一定要及时核实其真实性，避免上当受骗。
使用花呗付款是否会有短信提示取决于个人设置和交易情况，而花呗本身的安全性是有一定保障的，但用户仍需注意安全问题，保护好自己的账户信息。